生态指示种是能指示和判断自然环境的类型和特点的生物的总称。植物经常被用作水和土壤状况的指示生物。杂草群落的种类组成是农业生产潜力的最好指标。果松和桧树叶片中铀含量超过2mg/kg（灰分重）表明地下埋藏着有开发价值的铀矿。

生态指示种（群落）是在一定地区范围内，能指示环境条件或其中某一因子的存在和特性的物种（群落）。群落的指示意义一般要比物种大。生态幅度狭的、个体大的种的指示意义也较生态幅度宽的、个体小的种大。

生态指示种是能指示和判断自然环境的类型和特点的生物的总称。植物经常被用作水和土壤状况的指示生物。杂草群落的种类组成是农业生产潜力的最好指标。果松和桧树叶片中铀含量超过2mg/kg（灰分重）表明地下埋藏着有开发价值的铀矿。黄芪属（Aslragalus）植物是硒的指示生物，芥类和百合是硫的指示植物，它们都有探索铀矿的指示作用。早在1894年，梅里安（C.H.Merriam）就提倡利用无脊椎动物和植物作为温度带的指示物。

生物多样性的核心是物种，不同物种的作用和影响不同。生态指示种对环境变化敏感，能反映许多环境信息的物种；关键种是维持生态系统稳定的种，能维护其他物种的生境，促进关键的能源和物质流动等；庇护种是代表许多其他物种生境需求的种，是一种指示种；伞物种是对其他物种有保护作用的种；特殊兴趣种，包括流行的、魅力的、稀有物种等。指示种和庇护种不一定代表生物多样性的价值，价值取决于被指示的一系列物种的价值。关键种与调节功能相关，即生态系统恢复力（弹性），是指在环境变化压力下，能保持健康状态的能力。此外还有具有农业和药用价值的物种；与地方、国家和国际利用有关的物种。物种的濒危与否，与其在生态系统中的价值并不一定等同，因为传统的珍稀物种保护，不完全等同于生态多样性保护。