碳元素在自然界中循环的过程称为
碳循环。而要将碳元素传送到深海主要有两种途径。一种是以生物为动力的生物传递，另一种是以物理为动力的溶解传递（solubility pump）。生物传递的主要模式是沉降。即大量由生物形成的含碳微粒，如粪便和微生物尸体等从海洋的表层沉降到深海。沉降物中除了排泄物等有机碳外，还包含了无机碳。这些无机碳的主要成分是
碳酸钙(CaCO3). 而这些碳酸钙的主要来源是一些动物的钙化外壳，如有孔足目和
翼足目。有学者将生物传递中，有机碳的部分称为软组织传递，无机碳部分则称为硬组织传递。 有机碳在沉降过程中有可能腐败分解。当中的部分碳将转变为
二氧化碳溶解在水中。而碳酸钙是微溶物，也会有部分溶入到海水中。溶解量和速度根据该海域中碳酸离子浓度决定，碳酸离子浓度大，则通解速度慢。
生物传递在自然界的碳循环中扮演着重要的角色。大量的碳通过生物传递从海洋表面传送到深海。但由于难以测量，所以具体数量尚不可知。 相对于溶解传递来说，生物传递碳固化的效果更为显著。这一效果在石化燃料大量使用的今天有着更特殊的意义。可惜的是由于人类活动引起的大气中
二氧化碳含量的上升并没有使得海洋中植物的数量提升。这是由于海洋中植物比起陆地上的难获得二氧化碳。相反，有学者认为气候的转变可能会使得生物传递的作用降低。因为温室效应会提高海面表层的温度，这样被认为会减少透光层中的养分，导致该层中
初级生产的数量减少。