直立草本，高1.5—2.5厘米；根茎粗壮。叶片披针形或长圆状披针形，长26—30厘米，宽6—8厘米，先端尾状渐尖，基部楔形，两面无毛；叶柄长0.5—1厘米；叶舌全缘，长7—9毫米。
穗状花序卵形，长6—8厘米，从根茎基部抽出1—2枚，花序梗长5—10厘米，基部被覆瓦状排列的鳞片，下面的鳞片较小，向上逐渐增大，花序轴密被黄色茸毛；小苞片筒状，长2—2.5厘米，褐色，一侧开裂至近基部；花萼管状，长约2.5厘米，先端2裂，红色；花冠管与萼管近等长，裂片长2—3厘米，杏黄色，有明显的红色脉纹；唇瓣倒卵形，长2.5—3厘米，杏黄色，中央具紫红色脉纹及紫斑，先端2裂，边缘皱波状；侧生退化雄蕊钻状，药隔附属体半圆形，长5毫米，宽10毫米。蒴果椭圆形或球形，直径约2.5厘米，紫红色，被黄色柔毛及分枝刺，刺长3—6毫米。花期5—6月，果期6—11月。
果入药，能开胃消食、行气和中、止痛安胎。民间有作砂仁用。夏初时，橘红色的花序破土而出，中间开出杏黄色的花朵，它的雄蕊似蝶状，甚为奇特。可作为园林观赏或盆栽室内观赏。
可采用分株或播种繁殖。如要进行种子繁殖，可即采即播，也可沙藏至第二年春季气温转暖时播种。采用分株繁殖时，宜选择生长健壮的植株，操作时，切取带1～2条嫩根状茎的壮苗进行定植即可。疣果豆蔻在栽培的过程中，由于需水量大，要经常保持土壤湿润，特别是开花期要注意防旱，并在开花前和收果后要施肥培土1次，以利其花色鲜艳和花后恢复生长。