真核细胞型微生物(eukaryotic cell microbe)是指具有真正细胞核（即核质和细胞质之间存在明显核膜）的细胞型微生物。真菌细胞中没有光合色素，不能进行光合作用。真核细胞型微生物包括了真菌、真核藻类和原生动物。

真核细胞型微生物包括了真菌、真核藻类和原生动物。真菌的种类极多，是微生物中的一个庞大类群，据统计，真菌约有12万多种。真菌的菌体为单细胞或多细胞的分枝丝状体，或为单细胞的不分枝的个体。真菌细胞中没有光合色素，不能进行光合作用。真菌包括了单细胞的酵母菌、单细胞或多细胞的丝状霉菌以致产生子实体的蕈菇。

原核和真核微生物代谢产物是目前临床应用上具有重要价值的药物，几乎在各种疾病治疗领域都能发现这些药物的身影。1929年，英国细菌学家Fleming发现了青霉素，随后由Florey和Chain将青霉素用于疾病治疗并取得惊人的效果，这标志着抗生素时代的到来。1942年，美国科学家waksman发现链霉素并很快将其用于临床。随后，科学家又从微生物次级代谢产物中发现了一大批目前还一直于临床的抗生素(如庆大霉素、卡那霉素、红霉素、螺旋霉素、麦迪霉素和林可霉素等)以及一大批半合成β内酰胺类抗生素和其他类别的半合成抗生素，基本上控制了细菌感染性疾病，使人类的平均寿命延长了15年以上。

真核微生物是细胞核具有核膜、核仁，能进行有丝分裂，细胞质存在线粒体或同时存在叶绿体等多种细胞器的一类微生物。其广泛分布于自然界，种类很多，形态各异。

真菌按结构分为单细胞真菌和多细胞真菌两大类。

1、单细胞真菌：呈圆形或卵圆形，以出芽方式繁殖，如酵母菌、白色念珠菌和新型隐球菌等；

2、多细胞真菌：由菌丝和孢子组成。

①菌丝：孢子长出的嫩芽在适宜环境中延长呈丝状，称菌丝。菌丝的主要功能是吸收营养和水分，部分菌丝可分化成生殖器官。

②孢子：是真菌的繁殖结构，一条菌丝可长出多个孢子，孢子又可发芽形成菌丝，并发育成菌丝体；孢子分有性孢子与无性孢子2类。病原性真菌多属无性孢子。

真菌对热敏感，但对干燥、紫外及一般化学消毒剂抵抗力较强，对常用抗生素及磺胺类药物不敏感。灰黄霉素、制霉菌素和二性霉素B对某些真菌有抑制作用。

皮肤感染真菌后，在局部大量繁殖，通过机械刺激与其代谢产物的作用，引起局部炎症—深部组织，脏器感染的真菌遭吞噬细胞吞噬后，不被杀死而能在细胞内繁殖，刺激组织增生，引起组织慢性肉芽肿性炎症和组织坏死。