祖泽溥生于万历三十六年十二月二十四日(1609年1月29日)。其父祖大寿在
遵永大捷中立下首功后,他凭父荫成为锦衣卫指挥同知。后累升左都督。崇祯十七年(1644年),他作为南明
弘光政权所派的
左懋第、
陈洪范使团中的一员出使北京,谈判破裂后降清,授一等御前侍卫。后任武备院卿等职。顺治十八年(1661年)九月任山西总督,旋即调任山东总督,镇压胶东的
于七起义军,因功加兵部尚书衔。康熙四年(1665年)引病辞职。康熙六年(1667年)授福建总督,翌年召还,此后赋闲在家。康熙十八年四月十五日(1679年5月24日)去世。