祝耀祖，1937年12月生，浙江慈溪人。1960年4月加入中国共产党。1956年8月参加工作。大专文化。曾任浙江省人大常委会副主任。

历任杭州重型机械厂宣传干部，水产局机要秘书、计财处干部，水产厅计财处处长、党组成员，水产厅副厅长，水产局局长、党组书记（1982年8月－1983年8月在中央党校干部培训班学习）。舟山地委书记，舟山市委书记，浙江省委省级机关工委书记，省监察厅厅长、党组书记，省纪委副书记、监察厅厅长。1998年1月任浙江省人大常委会副主任。