《福建农林大学学报（自然科学版）》是综合性的
农业学术期刊，立足该校，面向社会，主要刊载作物科学、植物保护、园艺科学、林业科学、
生命科学、动物科学、蜂学、资源与环境学、食品科学、材料工程、计算机与信息科学、机电工程、交通等及相关学科的基础研究、应用研究和开发研究等方面的学术论文。读者对象为国内外有关专业的科技工作者、高等院校教师和研究生等。
本刊是综合性学术理论刊物，以
马克思列宁主义、
毛泽东思想、
邓小平理论和“三个代表”重要理论为指导，贯彻科学发展观，贯彻党的教育方针和“百花齐放、百家争鸣”的方针，主要反映该校的两个文明建设，刊发学术文章，反映科研成果，指导教学实践，交流科教学术信息，促进科教学术的繁荣发展。
主要栏目有：作物科学、植物保护、园艺科学、林业科学、
生命科学、动物科学、蜂学、资源与环境、食品科学、材料工程、计算机与信息、机电工程、交通运输等。