1998年10月，根据国务院的要求和福建省血液事业发展的需要，省编委批准成立福建省血液中心。2001年10月29日，福建省血液中心开始营运，主要负责福州地区采供血业务及全省采供血工作的业务指导和教学科研任务。

福建省血液中心坐落在闽江之畔，位于福州市西二环南路28号，交通便捷，环境优美。中心在市区设有2个爱心献血屋，8个固定采血点。

中心现有职工116人，其中专业技术人员97人，占职工总数的84%。中心内设献血服务、检验、质量管理、成分制备及血液供应、综合管理等科室和中国造血干细胞捐献者资料库福建分库定点组织配型实验室，配备了国际先进的采供血设备和后勤保障设施。

福建省血液中心拥有一个强有力的领导班子，始终坚持以“三个代表”重要思想为指导，以血液安全为中心，以开拓血源和严把血液质量关为重点，以培育自身造血能力为突破口，全面推进省血液中心的工作。

福建省血液中心还拥有一支年轻且极富活力的献血服务队伍。我们坚持先进的、以人为本的献血服务理念，坚持开展优质无偿献血服务，启动了献血者家园建设系统工程，着力定期献血者队伍建设，并制定了把献血者之家建设成为献血者自己的家的建设目标。

我们在献血者家园里分别成立无偿献血志愿者之家、机采成分血献血者之家、稀有血型献血者之家、定期献血者之家等，以家园的形式密切与献血者的联系，用家园的亲和力保留献血者，赢得了广大无偿献血者的信赖，实现了临床用血百分之百来自公民的自愿无偿献血，一次献血400毫升人次占无偿献血总人次的比例达到90%。

福建省血液中心始终坚持“质量第一”。中心全体员工牢固树立“血液安全从我做起”的理念，持续开展无偿献血宣传和献血全过程的优质服务，严把血液检测质量关，定期进行全员业务理论和操作技能培训，全面提升员工的综合素质，使省血液中心的各项工作实现了新的飞跃。

福建省血液中心还受卫生部委托，如期完成国家《血站质量管理规范》、《血站质量管理规范评审标准》和《血站实验室质量管理规范》、《血站实验室质量管理规范评审标准》的起草任务，同时参与国家《血站管理办法》的修订工作。我们拥有国家血站QMP培训师资3人，国家无偿献血招募培训师资1人，国家血站法规起草小组成员3人，国家医学考试专家组成员1人，国家血液信息统计协调员1人，国家血液标准委员会委员2人。

在省委省政府和省卫生厅的正确领导下，在国家卫生部的关心和指导下，我们紧紧抓住发展的大好机遇，求真务实，团结奋斗，2004年如期实现了“把血液中心建成全省采供血工作的业务、教学和科研中心”的三年奋斗目标，2005年5月，按照省政府的统一部署，省血液中心与福州市中心血站成功进行了实质性合并，提前实现了第一轮发展战略目标。

省市血站业务交接期间，整个采供血工作井然有序，正常稳定，血液库存充裕，满足临床用血需求，实现了采供血业务工作的平稳衔接。两站的合并解决了省会一市两站的历史遗留问题，这是福建省血液事业发展的一个重要里程碑。

在新的起点上，福建省血液中心将以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导,全面贯彻落实科学发展观，面向世界输血医学前沿，面向未来，坚持以血液安全为中心，依法治站，以德治站，着力创建学习型血站，创建以“责任、忠诚、敬业和激情”为核心的血站文化，实施人才强站战略，全面加强能力建设，为建设全国一流血站而努力奋斗，为国家血液事业做出新的贡献！

2020年11月，被授予“福建省抗击新冠肺炎疫情先进集体”荣誉称号。