系统目标是系统要达到预定目的所必须做到的具体指标。目的可用定性方式描述，目标则一般都需要定量描述。

目的可用定性方式描述，目标则一般都需要定量描述。例如目的是研制新一代战略洲际导弹，目标则包括导弹的射程、威力、精度、可靠性、能耗、研制进度、成本、可维修性和期望寿命等具体的数据。复杂大系统，特别是社会经济系统,往往具有多个目标。例如,为要达到提高生活水平这一目的，问题就涉及自然环境、人口、家庭、经济基础、财政、教育、医疗、劳动、社会保障、文化等许多方面，可列出上千个目标，形成一套完整的目标体系。选择系统目标要求准确，并要全面地反映系统所要达到的目的。目标不能是派生的，避免给系统评价带来困难。系统目标可分成若干层次，用目标树或目标自作用矩阵等形式表现整个目标体系。

目标树表现总目标、分目标、子目标之间递阶关系的树状结构（图1）。最上一层是总目标,然后再逐层分解，形成树状结构。

目标自作用矩阵 表示目标之间相互关系的矩阵(图2),凡有关系处用黑色表示,无关系处为空白。图1和图2所表示的是同一个目标体系。

系统的决策变量 x（多变量时则是向量）与目标的对应关系，可用目标函数J(x)来表示。目标函数可以是定量的(解析形式或数值形式)，也可以是定性的并授权分析人员作定量处理。例如目标函数具有单峰性（只有一个峰值，其他目标值都不如它）和单调性（目标函数值随着决策变量值的增加而增加）,而没有具体数值,可由分析人员给出判断值。对少数定性目标还可以由分析人员打分，使之成为定量目标，以便处理。

秋山穰等著，高烈夫译：《系统工程》，机械工业出版社，北京，1983。（秋山穰著：《システム工学》，コロナ社，东京，1977。）