原名卡特林纳斯，约翰出生在罗马城内一个颇有名望的家族里，他很快就在掌控了北亚平宁半岛的教廷里有了自己的位置，并最终在567年的7月成为了第六十一位罗马总主教（即后来的教皇）。他最终于574年的7月13日死亡。

约翰三世的时期发生了两件他所不能掌控，但却对他人生乃至历史却有着极大影响的事件。其一便是查士丁尼一世“伟大的”（“大帝”）的死亡，这使东罗马帝国（即拜占庭帝国）逐渐把注意力放在了巴尔干和小亚半岛，让教廷所在的亚平宁半岛在帝国的战略优先计划上垫底，间接性的造成了罗马教廷的独立和亚平宁的丧失。其二便是568年开始的伦巴第人入侵，他们很快的涌进了亚半宁北部和腹地，并且屡次进攻罗马城，同时还带来的新的雅利安信仰，对天主教带来了极大的伤害。