约翰九世（拉丁语：Ioannes IX，英语：John IX ，？-900年3月16日），又译若望九世，天主教教皇（898年3月12日-900年3月16日在位）。即位后，为僵尸审判平反昭雪，恢复了福尔摩苏斯教皇的名誉。

狄奥多尔二世死后数日，罗马教廷福尔摩苏斯一派推出意大利教士约翰继位，即约翰九世，另一方司提反六世的一派也抬出塞尔吉乌斯，企图强行登位。约翰在罗马城有强大势力，他原来是参议院议员狄奥菲拉克图斯公爵妻子狄奥多拉过去的情夫，深受他们的支持，于是约翰毫无顾忌的登上宗座，称约翰九世。当他遇到塞尔吉乌斯的挑战时，狄奥多拉亲自动手，暗中纠集了一批同伙，干脆将塞尔吉乌斯轰出罗马。约翰九世则宣布革除塞尔吉乌斯的教籍（904年塞尔吉乌斯又成为合法教皇塞尔吉乌斯三世），开始了他2年的教皇生涯。

约翰九世原是教皇福尔摩苏斯时期晋升的罗马司铎，他主持教廷工作，立即在罗马和拉文纳召开会议，再一次为福尔摩苏斯昭雪，谴责司提反六世组织的“僵尸审判”并撤销其各项决议，并将被司提反六世免职的教士重新复职。

约翰九世承认法兰克皇帝洛泰尔一世于824年颁布的《罗马建制诏》，此诏书确定了皇帝对罗马城的宗主权，并要求向皇帝宣誓效忠。约翰九世接受了诏书，并开了选举教皇必须由皇帝指派的使节在场的先例。教皇在900年3月16日去世。死后本尼狄克四世继位。