纯系（pure line）是由遗传上均一的纯结合个体所组成的系统的总称。

纯系 pure line

一般由所有有关基因均为纯合体的个体进行自交，或是通过长期的连续近亲交配而产生。因此，同属于一个纯系的个体，基因型全部相同。其所表现的变异乃是环境作用的结果，不会遗传给后代，只有突变才能使之有新的发展变化。在纯系中选择是没有效果的。由于实际上要育成具有严格科学标准的纯系很不容易的，所以通常只着眼于有关的基因范围内的纯系化，认为在其他基因方面只要不存在十分明显的变异就可以了。

只针对一个抗原决定簇起作用的浆细胞群就是一个纯系，纯系的英文为Clone，音译就是克隆。