细菌军团，是《喜羊羊与灰太狼之奇趣外星客》中虚拟团体，由细菌大王领导，全体成员包括变形杆菌（小黄），数码病毒（小绿），蘑菇菌（小紫），古细菌（小红）。以抓住冰冰羊，利用其指纹解锁细菌大王封印为主要目的。

《喜羊羊与灰太狼之奇趣外星客》系列大部分集数。

细菌军团首领，外观紫色，头顶三根触角，有封印前，封印后，解封后三种形态，爱耍赖皮，性格卑鄙，但是关心手下，表情夸张可爱，封印后仅存能力为控制入侵（只能入侵一些身体脏乱、免疫力差、生病抵抗力弱的动物的体内），控制后，该物体原有潜力将充分激发。解封后，主要攻击为能量波，能量束。

小名小黄，外形为黄色杆菌状，性格高傲，可以变成自己看到的任何东西，受刺激时会变回原形。

小名小绿，外形为绿色方块状，性格开朗爱吃，机智可爱，能在各种电器中穿梭并控制，只能控制有电的电器。

小名小紫，外形为紫色蘑菇状，性格腼腆善良，能力为释放毒气和治愈能力，情绪波动大时会失控。

古细菌

小名小红，外形为红色球菌状，性格淡定，能力为千菌甲防护盾，防御能力极强。

细菌军团是出自《喜羊羊与灰太狼之奇趣外星客》以虚拟团体，该团体首领细菌大王在智羊羊夫妇前获取一能令人丧失理智的邪恶力量，及时赶到的智羊羊夫妇控制住细菌大王，计划将他永久冬眠并封印后送往其他星系，不料智羊羊被装睡的细菌大王骗进关闭他的容器。

情急之下，偶然玩捉迷藏进入容器的冰冰羊不小心在封印锁录入自己指纹，被封印的细菌大王气急败坏地逃出容器，利用智羊羊柜中的武器冰封智羊羊夫妇，冰冻前的智羊羊夫妇将养女冰冰羊和自己发明的超能魔方送往青青草原，企求喜羊羊的保护，跟随冰冰羊的细菌大王来到青青草原，并居灰太狼家。

随后被细菌大王叫来的四个帮手（小黄，小绿，小紫，小红）陆续出现，和保护冰冰羊的众小羊斗争，最后细菌大王虽解封成功，但险些被邪恶力量吞噬，众羊菌救下细菌大王将被吞噬的本体，细菌军团全员帮助小羊击败分离的邪恶体，成功后乘载智羊羊的飞船回到自己的宇宙，修复之前被破坏的星球。