经食管超声心动图将食管探头从食管插入到心脏后方的左心房附近，从心脏后面观察心脏内部病变。目的是排除肺脏气体对检查心脏的影响。优点是图像更加清晰；缺点是切面较少。
适应证
1.感染性心内膜炎者。
2.心脏及大血管梗阻引起的休克病人。
3.胸痛的鉴别诊断，如夹层动脉瘤和心肌梗死后并发症的鉴别。
4.急性瓣膜功能障碍者。
5.心源性栓塞的病因诊断。
6.胸部外伤时心脏和大血管的并发症，如心脏破裂、主动脉离断等。
7.围术期心功能监测。
禁忌证
1.体质极度虚弱，持续高热不退，麻醉剂过敏者。
2.严重心律失常，严重心力衰竭，不稳定性心绞痛，急性心肌梗死，血压高或过低者。
3.咽部或食管病变如溃疡、静脉曲张病人等。
检查方法
经食管超声心动图检查前应禁食空腹。病人意识清醒，应向其介绍检查目的和经过，取得病人的合作。多取左侧卧位，将经食管超声探头送入病人口中，令其做吞咽动作，徐徐送入。
并发症
1.恶心、呕吐不适。
2.食管穿孔、出血或局部血肿。
3.黏膜麻醉剂过敏反位。
4.咽部出血或血肿。
5.口腔黏膜内容物误吸入气管导致窒息。
临床意义
1.冠脉病变如冠状动静脉瘘、冠状动脉起源异常等。
2.心腔内肿物及血栓形成，尤其对发现左心耳等经胸检查不易显示部位的血栓独具优势。
3.先天性心脏病房间隔缺损、室间隔缺损、右室流出道及肺动脉狭窄等。
4.主动脉病变如主动脉扩张、硬化斑块、主动脉夹层、主动脉撕裂等。
5.瓣膜病变如二尖瓣、三尖瓣、主动脉瓣疾病；人工瓣功能评价及判断是否存在瓣周漏。感染性心内膜炎检出赘生物、发现瓣叶破坏及脓肿形成等均优于经胸检查。
6.心脏及非心脏手术的术中监护。