耀县站建于民国29年（1940）11月，位置在咸同线的111公里+900米处。同时成立了耀县机务段。新中国成立后，随着咸铜线路的不断改建，耀县车站的中心公里改到111公里+228米处。1986年拆除旧票房及运转室另行新建。候车室及票房总面积为718平方米，前面有751平方米小型广场。站内客运站台长364米，宽10米，有行包房1座，面积为197平方米；货物仓库2座，面积294.7平方米；货物站台2座，面积2884平方米。并有8吨轨道电动吊车1台，25吨龙门吊1台。该站为三等中间站，亦为客货运站。
耀州站为咸铜线上 K110+722.2 处的一个中间站，共 4 条到发线（含 1 条正线），基本站台一座。本站电化Ⅱ、3、4 股道，并利用既有专用线设接触网岔线 1 条，平直段有效长不小于 60m 将靠近新建站台的 4 股道换为 60kg/m 无缝钢轨。另外，结合地方政府与路局意见，在既有站房对侧新建站房，相应地新建 240x6x1.25m 的基本站台 1 座，并对 4 股道拨道使其与 3 股道的线间距为 5m。
9月15日7时53分，随着D5291/0/1次“复兴号”动集动车组列车驶出铜川东火车站，驰往西安，标志着咸铜铁路正式迎来“复兴号”。“复兴号”动集动车组列车从
西安站始发，沿途经过
阎良站、
富平站、
庄里站、耀州站，最终到达
铜川东站。