但最终她因为对神真子身上的刺——联盟飞船寻天号残骸处理方式的分歧而与
季·火掌分道扬镳：如果不尽快移除飞船的残骸，那么神真子就将惨然面对死亡。而季提出的方案让艾莎难以接受——用炸药炸毁飞船的剩余部分，然后让联盟和部落的治疗者们一起帮忙救援受伤的神真子。艾莎认为这样太冒险，如果计划失败，那么神真子必死无疑，这意味着整个谜踪岛上所有生物的覆灭。
然而季还是执行了自己的计划。艾莎对季的做法非常不满，虽然他们心中都彼此爱慕对方，但最后还是走上了不同的道路。艾莎作为土水派熊猫人加入了
联盟阵营。而季则作为火金派熊猫人加入了
部落阵营。玩家这时也要自己做出不能反悔的抉择，加入联盟或者部落。
在
决战奥格瑞玛时，艾莎和季再次相遇。不同的是，这次季正被堕落酋长
加尔鲁什·地狱咆哮的爪牙们折磨着，要求他说出他根本不知道的秘密。在季就快丧命的时候，玩家救出了他。这时艾莎出现，看到季的样子她感到非常悲伤，说道：“季，真是对不起，现在我们可以在一起了，我们回
迷踪岛吧，你不要死。”“我要带他离开这里。”
在《
争霸艾泽拉斯》中，艾莎·云歌作为联盟大使驻守暴风城大使馆，帮助联盟招募同盟种族加入联盟。