英国国家医学研究所（National Institute for Medical Research），简称NIMR，成立于1920年，隶属于伦敦大学学院(UCL)，是由英国医学研究理事会（the UK Medical Research Council）资助的最大的医学研究中心。

英国国家医学研究所的前身为成立于1913年的英国医学研究理事会中央医学研究所，随后更名为英国国家医学研究所，最初的研究所在亨利·哈利特·戴尔（Sir Henry Hallett Dale）爵士的领导下，分为三个部门：

亨利·哈利特·戴尔在研究所取得了可观的成功，包括1933年发现人类流感病毒和神经递质乙酰胆碱的发现，戴尔本人因此获得了1936年诺贝尔生理学奖。

在1930年代，决定将研究所迁移到新的场所。最初的温布利球场的建筑师麦克斯韦·艾尔顿（Maxwell Ayrton）在米尔山（Mill Hill）设计了一座气势宏伟的铜屋顶建筑，该建筑于1937年开始建造。1939年战争爆发后，迁移工作被推迟，并将建筑物交给了皇家海军。这座建筑于1949年秋天归还给了英国医学研究理事会，戴尔于1942年退休，因此并未担任过新址的主管，这项工作由他的继任者Charles Harington爵士承担。

正式的开幕典礼于1950年5月5日举行，乔治六世国王和伊丽莎白女王出席。Harington在任职20年的期间将研究所扩展到十个部门，并指导研究所的研究人员取得了许多成就，包括开发气相色谱法和发现干扰素。从1950-55年，阿尔伯特·纽伯格（Albert Neuberger）担任研究所生物化学系主任。

1962年，诺贝尔奖获得者彼得·梅达瓦（Peter Medawar）爵士成为董事，并根据他的研究兴趣将NIMR确立为主要的免疫学研究所，梅达瓦于1971年退休，出任董事，由阿诺德·布尔根（Sir Arnold Burgen）爵士接任。布尔根（Burgan）对核磁共振技术感兴趣，并于1980年在研究所成立了生物医学所。戴里斯爵士（Sir Dai Rees）于1982年出任主任，并于1987年被约翰·斯凯赫尔（John Skehel）爵士接任。自那时以来，NIMR一直以出色的研究著称，比如在1991年发现了性别决定基因SRY。

2003年，作为英国医学研究理事会长期战略的一部分，Skehel宣布了计划考虑将NIMR的位置迁移到大学，以增强其“将生物医学研究转化为实际健康成果的能力”。 伦敦大学学院被选为接收院校，并选定伦敦市中心附近的一个地点最为其研究场所。

2006年9月，Skehel卸任NIMR主任，而Keith Peters爵士成为代理主任。当年7月，MRC宣布邀请了加利福尼亚理工学院的Scott Fraser接任该董事职位。

2015年4月1日，NIMR与英国癌症研究中心共同发起成立新的弗朗西斯·克里克研究所。