莆田军分区在福建省军区范围内划分的军事区域所设立的军队一级组织，以领导机关驻地莆田命名。
历史沿革
恢复闽侯军分区时，辖闽侯、连江、长乐、平潭、福清、永泰、闽清等7个县兵役局。
1961年12月，连江县人民武装部划归福州军分区建制。1963年9月起增辖罗源、连江、古田、屏南县人民武装部。
1970年7月，军分区机关迁莆田县，1971年5月改称莆田军分区。1971年改莆田军分区时，辖莆田、仙游、闽清、长乐、平潭、福清、永泰、闽侯县人民武装部。
1973年9月，闽侯县人民武装部划归福州警备区建制。
1983年5月，长乐、福清、闽清、平潭、永泰县人民武装部划归福州军分区建制。
1984年，莆田市人民武装部辖莆田、仙游县和新设的莆田市城厢、涵江区人民武装部。
1984年6月29日，福建省军区命令，撤销莆田军分区，增编师级莆田市人民武装部。
1985年10月，莆田市人民武装部改编为莆田军分区。
1986年6月改归地方建制时，莆田军分区所辖县、区人民武装部与莆田市人民武装部同。
工作职责
负责内防治安、民兵和兵役工作。
现任领导