莲因寺是南投县最富盛名的佛教胜地，因当代大师忏云师父所主持，不过只有在浴佛节或重要的佛学活动可以亲睹大师圣容，寺庙建筑典雅庄严，加上位置居高临下，因此不论是在清幽恬静的寺院间休憩或者入寺聆听法师讲解佛理与禅学，人生的困惑、世俗的烦忧都可将抛而一空，带着一颗平静的心下山。
忏云老和尚初出家时，本想参方四大名山、八大小山，当代高僧、善知识都想去亲近修学，之后，再依山傍水找地方修行。初出家即有这念愿心，但由于因缘变化，老和尚来到台湾，就在台湾的山间，依山傍水建设莲因寺。老和尚出家后，依止当代律宗大德
慈舟大师，传承丛林道场的作风，遵从佛祖一脉相承的佛法，以五堂功课为纲骨。
莲因寺日常作息，是典型的僧家丛林生活。山中鸟语花香，静谧永恒，莲因寺弥漫着｢道｣的幽静。每天清晨三点半起板，寺众在钟鼓声中上殿。香华灯烛罗列，炉香乍爇，法界蒙熏，梵音悠扬，讽诵楞严大悲十小咒、心经，再发十大愿王，每日照着发愿，宏阔心量，消业障，令心趋向定，开智慧。午休起，两点拜八十八佛，一佛一拜，再重的罪都能消除。也是最好的运动，全身血脉都通，胃肠都感觉消化。下午五点半作晚课，诵阿弥陀经，发愿求生净土，所有功课、功德都归趣净土。配合老和尚教授的法门，在大殿的两旁有念佛堂和蒙山殿。老和尚以经过百遍弥陀佛七的经验而开示云：观音菩萨反闻闻自性。 要是背着本觉理体 －真如自性、自性弥陀，去接触六尘，背觉合尘，那么三千大千国土都是怨贼，都是夜叉罗刹。 要是背六尘、万丈红尘而合乎觉性，背尘合觉，那么三千大千国土夜叉、罗刹、怨贼，都是六度万行的资粮。念阿弥陀佛就是背尘合觉，也就是反闻闻自性。三千大千国土的怨贼、夜叉罗刹，心里一背它，朝着不生不灭，清净本然的心－观照，那都是我们的自性，也是无量光明、无量寿命，称作自性弥陀。以自性弥陀的心，举心念西方弥陀，念到虔诚处，自他不二，这是抓到佛法的要点了，最宝贵的法门。
大殿的左边是蒙山殿，老和尚为度父亲之冤业，于父亲故去数日，寻依蒙山施食一法修持。后依止慈舟大师，更学施食。老和尚东渡来台，提倡五堂功课，编定《蒙山施食仪轨》。尝云：蒙山课诵宜结印作观，非只但诵真言。遂领寺众每晚八点在蒙山殿，躬依此法修持。
经云：施诸鬼食，便能具足无量福德，则同供养百千俱胝如来功德，等无差别。老和尚修持施食法六十余年，精诚如一，广运悲怀，普度群迷。常于大专学生斋戒学会教授施食，尝笑云：自未如古德撒粟米与鸟兽，以结法缘，何以同学一波一波虔诚来山，寒暑无间？盖恐施食普结法缘所致。在大殿的后面有讲堂，老和尚着重解行并进，曾编辑《解行合集》并作序文：夫苦空无常，实乃三界众生世俗之相。常乐我净是一真法界人人本具之性。吾人欲求解脱无常生死之苦，希求菩提涅槃之乐，其进修程序唯在信解行证四位阶段而已。凡我佛子信心已生，果证未得之间，唯有解行二门最为重要。古德云，解如目，行如足，两者缺一不可。倘有解无行，则如说食数宝，毫不得佛法之实益。有行无解，恐有盲修瞎练，堕坑落堑之害，未得法益，反自受损。故必须依解起行，解行并重，如鸟之二翼、车之双轮，相辅相成，庶可达到果证之目的焉。一切是因缘所生，老和尚四十九岁到水里开山，才建筑一排寮房，即有大专学生上山求法，遂成斋戒学会及佛七。莲因寺是老和尚在娑婆世界遍种西方九品莲之道场，传流佛祖一脉相承之佛法，其道风永远流芳。