菌丝（Mycelium）是在表面上不断释放微小孢子颗粒效果的方块。

菌丝只能够通过带有精准采集附魔的工具进行开采，否则只会掉落泥土。用锹开采是最快的。

菌丝只能够在蘑菇生物群系里生成。

末影人能够捡起菌丝，捡起后被杀死时有几率掉落。

菌丝可以传播到任何在同一高度以及相邻的泥土，它也可以传播到高1格和低3格的泥土。蔓延时菌丝需要9级以上的亮度，而被蔓延的泥土则需要4级以上的亮度，并且不能被任何可阻挡光线的方块或不透明方块覆盖。菌丝会在被可阻挡光线的方块覆盖或亮度低于4的时候变为泥土。

如果被蔓延的泥土上有树苗或花，树苗或花就会跳出地面，成为掉落的物品。西瓜和南瓜不会长在菌丝上。

在蘑菇生物群系中天然生成的洞穴和峡谷不会替换掉菌丝，通常会在峡谷底部留下薄薄的一层菌丝，或在洞穴中留下“条状”的菌丝层。