萧钧七岁时，出继伯父衡阳元王
萧道度，觐见生父
齐高帝萧道成，还未拜，就已经泪流满面，高帝拉着他的手说：“伯父叔父也想父亲一样，不要难过，之所以叫你出继，不过是由于你行事仁义，能够供奉祭祀的缘故。”并立即下令，如先例赐给通幰车、雉尾扇等，事事都依照正王（皇子）的规格。
萧钧的生母区贵人去世，萧钧居丧期间一切依礼行事，服丧期满，应当问讯武帝（
萧赜），萧钧已是身体虚弱，骨瘦如柴，三次登车都上不去，只好作罢。典签曹道人将情况都奏闻武帝，武帝就亲自到衡阳王府，见到萧钧，心中怆然，回宫之后，对
褚蓁说：“昨天见到衡阳王，没想到他瘦弱的那么厉害，卿可以常去抚慰他，使他高兴。”萧钧喜爱什么，崇尚什么，都被其长兄
萧赜（
齐武帝）所知，兄弟之间，齐武帝对他仅次于对待鄱阳王
萧锵。原先，区贵人将华钗厨子和翦刻锦绣中的倒炬，凤凰，莲芰，星月之类的都赐给萧钧，作为把玩之物。区贵人去世之后，每逢时节以及初一，十五，萧钧都开箱凝视，哽咽着再三下拜，看见的人都为之悲怆。
勤奋好学，出继伯父衡阳王道度。历任
江州刺史、
散骑常侍、
骁骑将军、左卫将军、
中书令、领石头戍事。隆昌元年(494)，加位侍中。个性至孝，善于作文。
萧钧生性好学，擅长作文，与琅琊郡的王智深以文章相交，济阳郡的
江淹也参与其中，
齐武帝对王俭说：“衡阳王应学习文学，要使他与名实相当，不能只为贵族子弟而已。”于是派太子舍人
萧敷（
萧衍之兄）教衡阳王萧钧文学。
萧钧立身处世清雅率真，言谈之间从不涉及时事。会稽孔稚珪家中多处建有假山和泉水，几乎接近大自然的情趣，萧钧前去游览，
孔稚珪说：“殿下身处贵族门第，在宫廷中到处游览，怎能与隐居的山人交往呢？”萧钧答道：“我虽身在贵族门第，情志却遍游江海：身在宫廷之中，意趣却在淡泊青云。”
孔稚珪对此言大加赞美。
吴郡
张融清高绝俗，即使面对王公贵族，也是很傲慢地看待他们，惟独很看中萧钧，曾对堂兄
张绪说：“衡阳王有飘然凌云之气，他的清雅风情，高洁意韵，实足令人怀念，我与它交往，都不知自己老之将至了。”萧钧被当世名士推崇到了这种地步。
隆昌元年（494年），改加侍中，配给扶侍一人。同年，郁林王
萧昭业被废，权臣
萧鸾立其弟海陵王
萧昭文即皇帝位，调萧钧为抚军将军，侍中照旧，不久遇害（明帝屠宗），时年二十二岁。
萧钧经常自己亲手用小楷书写《
五经》，合为一卷，放在巾箱中，以备遗忘时翻阅，侍读贺玠问道：“殿下家中自有古代典籍，又何必蝇头小楷抄一遍，另外藏在巾箱中呢？”萧钧答道：“巾箱中藏有《五经》，既便于检阅，而且一经手写，便永世难忘。”诸王听说，纷纷争相效仿抄写巾箱《五经》，巾箱《五经》从这时起便开始流行于世了。