蛋白质晶体结构，对蛋白质晶体用X射线衍射法解出蛋白质分子中各原子排列的三维结构。在晶体中各蛋白质分子以有序的晶胞形式重复排列，其形成受蛋白质的纯度和浓度、pH值、温度、沉淀剂等影响。由于遗传工程、同步辐射装置、探测和分析技术、结晶自动化等技术的飞跃进步，已获得的蛋白质晶体结构从最初“蛋白质数据库”中仅有的7个增加到74765个。为结构生物学的主要研究对象，对了解生物体内蛋白质的各种生物学功能、外界各种因子对细胞的作用、药物分子设计等方面提供结构基础。