西安市轨道交通集团有限公司于2005年11月11日成立。法定代表人为宋杨。

公司经营范围包括：地铁、轻轨、单轨、有轨电车、磁悬浮、自动导向轨道、市域快速轨道等城市轨道交通项目的投资及其建设、运营、资源经营和上盖开发、管理；货物及技术的进出口经营；物业管理、咨询业务；企业内职员工培训业务等。

2021年6月，中共西安市轨道交通集团有限公司委员会被西安市委授予“西安市先进基层党组织”称号。

2022年4月，被表彰为2022年陕西省先进集体。

党委书记、董事长宋扬：主持集团党委、董事会全面工作

党委副书记、副董事长、总经理马钢：主持集团行政全面工作

党委副书记陈红：负责党工团建设、宣传、意识形态、文化建设、人力资源、企业管理、政务公开、计划统计、资源开发等方面工作，分管党群工作部、人力资源部（党委干部部）、企业发展部、资源开发公司

党委委员、纪委书记宁春林：负责党风廉政建设、纪检、监察、地铁保护执法、PPP 项目等方面工作，分管集团纪委、监察专员办公室、轨道交通管理与保护办公室

党委委员、副总经理王超：负责资产管理、审计、TOD 综合开发、对外投资、市场拓展等方面工作，分管资产管理部、土地拓展中心、投资发展公司

党委委员、副总经理杨军：负责党务政务服务、信访、档案管理、财务管理、资金管理、信息化等方面工作，分管综合办公室（董事会办公室）、财务部、信息化办公室

党委委员、副总经理董红杰：负责合同管理、法务、运营管理、保租房建设管理等方面工作，分管合约法务部、运营管理部、运营分公司、城际铁路公司、保租房公司，联系地铁公安分局工作

党委委员、副总经理康佐：负责线网规划、技术、科研、工程建设、安全生产、质量监督、应急管理、反恐等方面工作，分管总工程师室、安全质量部、技术中心、建设管理部、建设分公司

2005年11月，西安市地下铁道有限责任公司成立；

2011年7月18日，西安市政府常务会议审定西安地铁票价方案；

2011年8月9日，《西安市城市轨道交通条例》对外颁布，9月1日正式实施；

2011年9月16日，西安地铁2号线通车试运营，为西北地区首条开通的地铁线路，西安成为全国第十个拥有地铁运营线路的城市。

2018年1月1日，西安地铁扫码过闸发布会暨蚂蚁森林西安城市公益林签约仪式举行，元旦起正式开启扫码乘车。

2018年7月24日，西安市地下铁道有限责任公司更名为西安市轨道交通集团有限公司的请示获西安市国资委批复。

2019年10月17日，哥伦比亚首都波哥大，哥伦比亚总统杜克、副总统拉米雷斯、波哥大市长佩尼亚洛萨、交通部长奥罗斯科出席波哥大地铁授标仪式，现场正式宣布：中国企业联合体Transmimetro中标波哥大地铁项目。这标志着西安地铁实现了走出去战略第一步。

2020年1月21日，西安地铁刷脸乘车系统正式上线。

2022年8月8日，以陕西省铁路集团有限公司和西安市轨道交通集团有限公司为基础合并组建陕西轨道交通集团有限公司成立。

2023年12月，有网友通过人民网“领导留言板”向西安市委书记方红卫反映，称“本人在西安地铁一号线三期白马河地铁站从事机电安装工作，因工程结束于9月5日离职，当时承诺10月初结清所有工资，后面违约，说没有和项目结算没钱结工资，现在已经拖欠3个多月了。”

对此，西安市轨道交通集团有限公司12月22日在该条留言下回复称，西安地铁1号线三期工程施工总承包2标安装装修二分部中铁二十一局集团有限公司（以下简称二十一局）与江苏天建机电安装工程有限公司签订了劳务分包合同，您为江苏天建机电安装工程有限公司员工。经核查，拖欠您工资共计35500元。

回复还称，西安市轨道集团于2023年12月11日上午11时30分电话联系您沟通，您要求尽快支付欠款。经协调，所欠款项由西安地铁1号线三期工程施工总承包2标总包部中铁建电气化局集团有限公司通过农民工工资专户在2023年12月15日前完成支付。市轨道集团于12月14日10时20分、11时30分、12时00分多次电话联系您，无法联系到您进一步解释。 西安市轨道集团后期将督促施工单位二十一局确认欠款查收工作。