西藏自治区人民医院为集医疗、教学、科研、急救、保健、预防为一体的西藏地区规模最大的三级甲等综合型公立医院，在满足区域基本医疗保障的同时，是西藏自治区疑难重症诊治指导中心、“大病不出藏”兜底医院，是西藏医学人才培养和高原病研究的核心基地，是国家级区域医疗中心，是“西藏大学人民医院”“徐州医科大学西藏临床学院”。
2023年7月，自治区人民医院按照《精神卫生法》《健康中国2023年规划纲要》《关于加强心理健康服务的指导意见》《10部委关于印发全国社会心理服务体系建设试点工作方案的通知》等法律规划政策的要求，正式开设心身医学门诊。
（一）、内设机构：党委办公室（内设科室2个：宣传科、信访办）、医院办公室（内设科室1个：援藏办）、纪检监察审计处（内设科室1个：审计科）、人力资源管理处（内设科室1个：离退休人员服务科）、医务处（内设科室3个：医政科、医患办公室、医保物价服务中心）、护理部、科研教育处、财务处（内设科室2个：财务科、招标采购科）、信息管理处、干部保健处、运营管理处、器材处（内设科室3个：医学装备科、物资供应科、固定资产管理科）及后勤服务中心（内设科室3个：总务科、基建房管科、安全保卫科）。
（二）、专业科室（不定级别）：风湿免疫血液科、高山病心血管内科、保健特需部、消化内科（内窥镜中心）、神经内科（心理卫生科）、内分泌科（临床营养科）、呼吸与危重症医学科（睡眠中心）、肾脏内科（血液净化中心）、肿瘤内科（肿瘤治疗中心）、普通外科、骨科、心胸外科、泌尿外科、神经外科、妇科、产科、儿科、手术麻醉科、重症医学科、五官科、中医科、皮肤性病科（皮肤美容中心）、康复医学科（高压氧治疗中心）、口腔科、眼科、耳鼻咽喉科（医学整形外科）、药学部、放射科、超声医学科、检验科（临床检验中心、遗传医学研究室）、输血科、病理科、感染性疾病科（发热门诊）、门诊部负、保健门诊、健康管理中心、消毒供应中心、急诊科、全科医学科、病案质控中心、医院质量管理办公室、医院感染控制办公室。
李虹：西藏自治区卫生健康委员会党组成员，西藏自治区人民医院党委书记、副院长。负责自治区人民医院全面工作。
吴东：北京协和医院党委常委、副院长，西藏自治区人民医院党委副书记、院长。
1950年9月8日开始，中央人民政府代表
张经武随行医疗组、十八军卫生部、重庆支援解放西藏医疗队（称为西南医疗队）、科工队医疗组、中央医疗队（称西北医疗队）共近百名医务人员陆续抵达拉萨。1951年12月26日，从各路进藏医疗队抽调部分人员成立了解放军拉萨门诊部，地址在老城区一个当时称为“联欢社”的地方（原国民党办事处小学），负责人为十八军卫生部医务主任张学彬。
1952年9月8日，在解放军拉萨门诊部的基础上成立了我院的前身──“拉萨市人民医院”，西藏军区卫生处副处长张学彬为首任院长。1957年，医院迁至新址（亦即现址），医疗条件大为改善。1962年，新的拉萨市人民医院建成后，我院更名为“西藏自治区人民医院”。1988年10月，医院更名为“
西藏自治区第一人民医院”（但我院仍然沿用“西藏自治区人民医院”的原名），核定病床编制500张（实际开放371张）、人员编制854人（实有在编职工721人）。2011年1月，医院升格为自治区卫计委管理的副厅级单位并恢复院名为“西藏自治区人民医院”。
2024年4月，为提升患儿在医院的就医体验，满足患者个性化就医需求，更好地服务血友病患儿，自治区人民医院儿科在儿童肾脏/遗尿专科门诊的基础上新增“血友病专科门诊”，为血友病患儿提供综合、精准的诊疗服务。