质体醌是一种苯醌的衍生物。醌环上联2个甲基，有一侧链联着不同数目的异戊二烯单位。

植物体中有几种PQ，它们的区别是异戊二烯单位数目不同。叶绿体中最多的是PQ9。在光合链中，既可传递电子，又可传递质子，其氧化还原反应：氧化还原电位约为0.1伏。氧化型的PQ从类囊体膜的靠外一侧接受电子，并与膜外质子结合，尔后向内扩散，在膜内侧被细胞色素f氧化，交出电子，同时把质子释放到膜内腔。即伴随PQ氧化和还原作用，使质子从膜外横渡膜进入膜内腔。这种质子的移动与光合磷酸化有关。

质体醌是质子和电子载体,同线粒体的电子传递链的泛醌一样，也是通过醌和醌醇循环来传递电子和氢质子,不过质体醌与泛醌的结构是不同的。