转基因土豆，是科学家通过
基因技术根据需要改变土豆的基因以得不同类型的土豆。有的是生产需要改变土豆基因以得到单一成份的土豆，有的是加入抗病毒疫苗后给人直接食用的土豆，有的改变土豆基因得到不同口味的土豆。
土豆在自然生长过程中会产生多种配糖
生物碱，其中最重要的是 α- 茄碱和 α- 卡茄碱，占土豆总配糖生物碱含量的 95%。土豆块茎中配糖生物碱含量最低，芽、皮和芽眼周围含量最高。因此食用正常土豆时，摄入的配糖生物碱量无需担心，但如果是发芽的土豆，会导致配糖生物碱摄入量超标而中毒，400m g 的茄碱就能使成年人致命。来自
日本理化学研究所、大阪大学等机构的研究人员最新研究发现，土豆的 2 个基因 P G A 1 和 P G A 2 分别与 α-茄碱和 α- 卡茄碱的生物合成途径有关。利用
转基因技术抑制这 2 个基因作用后，土豆中这 2 种物质的含量会大大降低，同时植株的生长和块茎的成熟并不受影响。土豆收获后会有几个月的“休眠期”，过后土豆就会开始发芽，因此很难长年保存。研究还发现上述 2 个基因被抑制后，土豆在存储期间也不会发芽。这项研究使得抑制土豆生成毒素乃至控制土豆发芽成为可能，将有助于提高食用土豆的安全性以及存储管理的便利性。
另一个是 1996 年巴斯夫向欧盟申请了一个叫做 Amflora 的转基因品种。土豆的主要成分是淀粉，包括直链淀粉和
支链淀粉两类分子结构。支链淀粉可以溶解于水中，大大增加粘度，在制造
生物聚合物方面很有价值。而直链淀粉不溶于水，对于形成生物聚合物会帮倒忙。对于加工而言，单纯的支链淀粉就要优越得多。而这个 Amflora，是通过调控土豆本身的基因，抑制它生成直链淀粉，从而得到了“支链淀粉土豆”。这对于工业加工而言，自然就很有吸引力。巴斯夫的申请只是用于工业产品和动物饲料，并非用于食品，经过了十几年的等待，直到 2010 年才获得了种植许可。
最早拿到转基因土豆的商业化种植许可的，是孟山都的一个抗病毒品种 New leaf。1996 年，这种转基因土豆开始了种植，到 1999 年，种植面积达到了近 40 万亩。然而当美国最大的土豆用户麦当劳要求供应商不要种植这种转基因土豆，这基本上就宣告了这个土豆品种的末日。2001 年之后，这个土豆品种黯然退出了市场。
辛普洛特因60年前发明了冷冻薯条而知名，是麦当劳等快餐企业的薯条供应商。该公司在一份声明中说，这种转基因土豆经过了10年的科学研究、安全评估和广泛的田地试验。与普通土豆相比，它在收获和储存过程中擦伤表皮而变黑的几率减少40%，另外在烹饪过程中可降低
丙烯酰胺的产生。丙烯酰胺被认为是一种潜在致癌成分。
该公司还表示，
美国食品和药物管理局有望很快完成对这种转基因土豆作为食品的安全性评估，希望2015年春季可在有限的测试市场上引入这种土豆。
美国是全球
转基因作物种植的第一大国。种植的转基因作物包括玉米、大豆、棉花、油菜、甜菜、紫苜蓿、木瓜和南瓜等，其中棉花、大豆和玉米种植面积最广。