辣椒环斑病毒(Chilli ringspot virus, ChiRSV)于2007年在越南首次被发现,GenBank中报道了两个ChiRSV越南分离物(ChiRSV-VN/C8, ChiRSV-VN/C9)基因组3'端长约1.6kb的核苷酸序列(DQ925438, DQ925439),2009年龚殿等利用RACE法和基因组步移法(Genomic walking method)成功获得辣椒环斑病毒英州分离物(ChiRSV-HN/Yingzhou)的全基因组序列(JQ234922),从而首次在世界上报道了ChiRSV的全基因组序列,通过分析确立了其在生物进化史上的地位,ICTV于2009年将ChiRSV划为马铃薯Y病毒科(Potyviridae)、马铃薯Y病毒属(Potyvirus)的确定种。
辣椒环斑病毒(Chilli ringspot virus,ChiRSV)是近年才被发现的新病毒.自1923年,黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus, CMV)被证实能够侵染辣椒以来,世界各地已报道超过45种植物病毒能够侵染辣椒。
Potyvirus基因组全长约为10 kb,为正义单链RNA病毒,被接近2000个外壳亚基包裹着,其5’端共价结合基因组连接蛋白(viral genome-linked protein,VPg), 3'端为多聚腺苷酸尾,即poly (A)结构。Potyvirus基因组只包含一个较大的开放阅读框(ORF),进行表达时会先翻译出一个大的约含3000-3500个氨基酸(aa)的多聚蛋白,再通过基因组自身编码的蛋白酶将多聚蛋白裂解和加工成成熟的蛋白质,多聚蛋白经加工后形成的成熟蛋白质从N-端到C-端(图1-1)M衣次为第一蛋白(the firstproten, PI)、辅助成分?蛋白酶(helper component-proteinase,HC-Pro)、第三蛋白(the thirdproten, P3)、第一个 6K 蛋白(6 kD protein 1,6K1)、圆柱状内含体蛋白(cytoplasmic inclusionprotein, CI)、第二个 6K 蛋白(6 kD protein 2, 6K2)、核内含体蛋白 a (nuclear inclusionprotein a~viral genome-linked protein, NIa-VPg)、NIa 蛋白酶(nuclear inclusion proteina~proteinase, NIa-Pro)、核内含体蛋白 b (nuclear inclusion protein b, Nib)和外壳蛋白(coatprotein, CP).