运粮河是南京市江宁区与玄武区的界河，从区界东南端向西流经区境约1910米，系人工河，明太祖朱元璋为从东郊运粮至城内军用，特开此河，故名。此河河北堤是区内历年防洪重点地段，1999年将堤岸加宽、加高，堤、路两用。

一期工程建成后，将实现秦淮河经运粮河至九乡河入长江的河道联通线路，可分泄洪水约150立方米/秒，初步缓解秦淮河流域、南京主城和东山、仙林副城的防洪排涝压力，治理河段的水生态环境也将得到有效改善；二期工程实施中心河开挖7.8公里，七乡河拓挖14.4公里（含隧洞2.0公里）。完成后，秦淮东河工程可发挥全部效益。整个工程计划分两期实施，十年完成，工程建成后将有效缓解南京主城和仙林、东山副城防洪压力，秦淮河流域达到50年一遇的总体防洪能力。