近交系数的概念最初由S.Wtight(1921)提出时是作为结合的
配子间
遗传性的相关而赋予定义的，后来才由G.Malcot(1948)给予上述定义，已广泛应用这个定义。可以把近交系数理解为形成
合子的两个配子来自同一共同祖先的概率。
近交系数（inbreeding coefficient）是指根据
近亲交配的世代数，将基因的纯化程度用
百分数来表示即为近交系数，也指个体由于近交而造成异质基因减少时，
同质基因或
纯合子所占的
百分比也叫近交系数。普通以F或f来表示。
群体中个体的平均近交系数为f时，而群体中杂合体的频率要比按温伯-哈代定律预期的f的比率低。以人为例，
近亲婚姻所生子女的近交系数，表
兄弟姐妹结婚的为1/16，半表兄弟姐妹结婚的为1/32，从表兄弟姐妹结婚的为1/64。
如
等位基因a的频率为p，等位基因A的频率为q，则子代
基因型AA频率为(1-f)*q^2+q*f，基因型aa频率为(1-f)*p^2+p*f，基因型Aa频率为(1-f)*2*p*q，其余以此类推。