遂宁军分区最早成立于1950年3月，1958年10月因
遂宁专区并入
绵阳专区而撤销，1985年2月在设立地级
遂宁市后重新建立，现隶属
成都军区四川省军区建制，为
正师级单位，是遂宁市的
军事指挥机关，同时是中国共产党遂宁市委员会的军事工作部门和
遂宁市人民政府的
兵役工作机构，受四川省军区和
遂宁市委、市政府
双重领导。
1950年3月，
中国人民解放军遂宁军分区成立，由中国人民解放军第181师兼，隶属
川北军区建制。
1952年9月川北军区撤销并入四川军区后，遂宁军分区改隶属四川军区（后改为
四川省军区）建制。
1986年6月，四川全省214个县（市、区）
人民武装部改归地方建制，性质、任务不变，受地方和军队双重领导。
1997年12月28日，析蓬溪县置
大英县；2003年12月18日，撤销遂宁市市中区，分置遂宁市
船山区、
安居区，至此，遂宁军分区辖2区、3县人民武装部。