2016年，邸子健进入中国国家羽毛球队青年队，并改打男双，与浙江队的
王昶搭档。
2017年，邸子健入选中国国家羽毛球队。4月19日，在2017年中国羽毛球大师赛中，邸子健/
郑斌斌止步首轮。7月30日，在2017年亚洲青年羽毛球锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以2-0（21-19、21-11）战胜韩国组合李相旼/
罗星升，获得冠军。10月22日，在2017年世界羽毛球青年锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以1-2（14-21、21-15、13-21）负于日本组合
金子真大/
久保田友之祐，获得亚军。11月28日，在2017年韩国羽毛球大师赛男双资格赛中，邸子健/王昶以1-2（21-17、20-22、17-21）负于韩国组合金正镐/韩尧新，无缘正赛。
2018年4月15日，在2018年中国陵水羽毛球大师赛男双决赛中，邸子健/王昶以1-2（21-19、17-21、16-21）负于
韩呈恺/
周昊东，获得亚军。6月24日，在2018年加拿大羽毛球公开赛男双半决赛中，邸子健/王昶以0-2（14-21、16-21）负于德国组合
马克·拉姆斯福斯/马尔文·赛尔德，止步4强。7月17日，邸子健帮助中国队获得2018年亚洲青年羽毛球锦标赛混合团体冠军。7月22日，在2018年亚洲青年羽毛球锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以2-1（18-21、24-22、21-19）战胜
商亦辰/
梁伟铿，获得冠军。8月15日，在2018年全国羽毛球单项锦标赛混双决赛中，邸子健/
刘玄炫以0-2（17-21、13-21）负于
裴天轶/
吴茜茜，获得亚军；同日，在2018年全国羽毛球单项锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以2-1（16-21、21-16和21-11）战胜
柴飚/
张稳，获得冠军。8月31日，在2018年中国羽毛球俱乐部甲级联赛决赛中，邸子健获得亚军。9月12日，邸子健被国家体育总局授予运动健将称号。11月11日，邸子健帮助中国队获得2018年世界青年羽毛球锦标赛团体冠军。11月19日，在2018年世界青年羽毛球锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以2-0（21-19、22-20）战胜韩国组合申泰阳/王灿，获得冠军。
2019年1月16日，在2019年马来西亚羽毛球大师赛男双首轮比赛中，邸子健/王昶以1-2负于马来西亚组合
吴蔚昇/
陈蔚强，无缘次轮。5月12日，在2019年全国羽毛球团体冠军赛中，邸子健代表八一队参赛，获得亚军。7月28日，在2019年亚洲青年羽毛球锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以1-2（9-21、21-15、19-21）负于印尼组合
卡尔南多/
马丁，获得亚军。10月13日，在2019年世界青年羽毛球锦标赛男双决赛中，邸子健/王昶以0-2（19-21、18-21）负于印尼组合卡尔南多/马丁，获得亚军。10月23日，在2019年法国羽毛球公开赛男双首轮比赛中，邸子健/王昶以1-2（21-19、11-21、17-21）负于印度尼西亚组合
吉迪恩/
苏卡穆约。11月，邸子健获得2019年德国羽毛球公开赛男双冠军。12月1日，在2019年印度国际羽毛球挑战赛男双半决赛中，邸子健/王昶以1-2负于
何济霆/
谭强，无缘决赛。
2020年11月4日，在2020年全国羽毛球锦标赛单项赛男双1/64决赛中，邸子健/
李俊慧以1-3（11-13、11-8、8-11、8-11）负于刘泽润/
陈铿。
2021年4月28日，在2021年全国羽毛球冠军赛男双首轮比赛中，邸子健/
刘粮毓以0-2（19-21、14-21）负于
邓家强/
吴拓斌。10月，邸子健入选2020汤姆斯杯羽毛球男子团体赛中国队参赛名单。10月19日，在2021年丹麦羽毛球公开赛男双首轮比赛中，邸子健/王昶以0-2（6-21、19-21）负于印尼组合
菲克里/
毛拉纳，无缘次轮。11月10日，邸子健入选2021年羽毛球世锦赛中国队参赛名单。12月14日，在2021年羽毛球世锦赛男双首轮比赛中，邸子健/王昶以0-2（9-21、13-21）负于日本组合
古贺辉/
斋藤太一，无缘次轮。
2022年2月10日，邸子健被网友（疑为前女友）指控在国际赛事打假赛。指控涉及2021威克多丹麦公开赛男双比赛，邸子健与王昶以6-21输掉首局，最终0-2不敌印尼组合。