部门审计是“内部审计”的一种。指国家机关各部门和各企事业单位的主管部门或系统所设立的内部审计机构，对本部门及其所属各企事业单位的财务收支及其经济效益所进行的综合经济监督活动。部门内审机构在本部门负责人领导下，在同级国家审计机关及上级审计机构的业务指导下开展审计工作。

内部审计是“外部审计”的对称。是由部门、单位内部设置的专职机构及人员，独立地对本部门、本单位的财政财务收支及有关经济活动进行审查，用以健全内部控制，维护财经纪律，改善经营管理，提高经济效益的综合经济监督活动。内部审计在我国审计组织体系中，起着以国家审计为主导，以内部审计为基础的重要作用，支撑着企业审计工作。其本质在于，作为企业指挥者管理机能的一部分，对企业管理手段妥善与否、有无弊漏和是否经济有效，进行经常性的检查、分析和评价。内部审计的主要缺陷和特点是，由于在本单位领导下进行审计活动，其独立性不及外部审计;但比之外部审计更具有及时性、连续性、针对性、预防性等特点，这些优越性使外部审计无可比拟。