他是
泌尿外科医生，与妻子许舜莉有三名子女。原本是
中西区区议会民选区议员，在2004年立法会选举医学界别中胜出，2004年12月被委任为医院管理局成员。
郭家麒积极反对其母校
香港大学以
李嘉诚为医学院命名，并声言发起全球港大医学院校友筹款，赎回医学院原名。医学院于2006年1月1日正式命名为「
香港大学李嘉诚医学院」。
2020年11月11日，根据全国人大常委会就香港特区立法会议员资格问题所作出决定，原定于2020年9月6日举行的香港特区第七届立法会选举提名期间，被香港特区依法裁定提名无效的郭家麒第六届立法会议员，即时丧失立法会议员资格。郭家麒为香港特区第六届立法会议员，因不符合《立法会条例》规定，2020年7月30日被香港特区政府选举事务处负责香港特区第七届立法会选举的选举主任裁定其提名资格无效。
2022年9月5日，据香港高等法院消息，香港非法“初选”活动涉嫌违反香港国安法一案在高等法院进行案件管理聆讯。其中5名被告郭家麒等认罪，他们被控串谋颠覆国家政权罪。