在涂抹法与压碎法中，醋酸洋红常被用作核、染色体的固定和
染色剂。在煮沸的45%醋酸中加洋红使之饱和，再加入微量的铁离子，便使醋酸洋红材料在为
醋酸固定的同时，洋红将核或
染色体染成红色。
在“观察植物细胞
有丝分裂”（即“观察根尖
分生区组织细胞”）时，对染色体进行染色，需要用碱性染液，此时可以使用醋酸洋红或龙胆紫染液。虽然这两种颜料称做
碱性染料，但其溶液呈酸性。
酸性（碱性）染色剂的界定并非由染料溶液的
pH值决定的，而是根据染料物质中
助色基团电离后所带的电荷来决定。一般来说，助色基团带正电荷的染色剂为碱性染色剂，反之则为酸性染色剂。