重庆交通大学科学城校区（原名重庆交通大学双福校区）是重庆交通大学位于重庆市江津区
双福新区的新校区，地处重庆市二环以内。重庆交通大学科学城校区占地2400亩，批准建筑总面积85万平方米，目前科学城校区已完成一、二期建设，建成了包括公共教学楼、南区学生宿舍和食堂、学生活动中心、土建工程教学实验基地、风雨操场等共31.02万平方米。校区于2017年9月正式开园投入使用，已有山区桥梁与隧道国家重点实验室、国家内河航道整治工程技术研究中心等高等科研机构和15个学院1.2万余名师生入驻，目前主要承担本科一、二年级的教育教学任务。
重庆交通大学科学城校区位于
重庆西部新城江津双福新区福星大道，紧邻重庆外环高速，远眺
缙云山脉，设施现代，环境舒适，是学校潜心育人的沃土。浅丘地形，视线开阔，自然环境良好。李子湖、明德湖镶嵌其中，展现生态湿地景象；
思源广场、
茅以升广场体现人文底蕴，彰显学校特色。
在建设选址方案上，经过多方论证和比选，学校决定在继续建设好七公里主校区的同时，初步选择重庆
双福新区李子湖地块，建设
重庆交通大学新校区。重庆双福新区，位于重庆市2020年
城市总体规划中主城西部片区的走马功能区，是主城重点拓展区之一。李子湖地块位于双福新区东北角，绕城高速以内，紧邻
九龙坡巴福镇和
九龙工业园C区，地势平缓、交通便利，距七公里主校区40公里左右、车程时间40～50分钟，规划有中小学和医院等配套设施，基本具备建设条件。此方案用地面积能满足学校发展需要，征地成本学校财力可以承受；同时，江津区大力支持学校发展，态度坚决，措施具体。此方案得到市教委和市政府认可。学校拟以行政划拨方式，按照与大学城一期建设地价持平的标准，在此征2500亩教学科研用地；拟以出让方式新征400～500亩生活用地建设教职工生活园区，地价在征地成本以内。学校将本着求实、创新、求精、节俭的原则，充分吸取其他高校建设的成功经验，高水平整体规划，量力而行分步实施，兼顾建设与运行，努力建设“分区合理、特色鲜明、设施完善、环境优美，富有历史与现代人文气息”的新校区。其中，教育园区建设占地约2100亩，确保2011年首批学生入住新校区，远期入住学生达到合理规模；科技园区建设占地约400亩，2011年实现西科所搬迁扩建、升格为“西南水利水运科学研究设计院”，同时建设学校其他产学研基地；学校将积极争取政策，按照“降低成本，保证质量”的原则，建设环境宜人、配套完整、教职工满意教工生活园区，生活园区占地约400～500亩。
新校区建设拟分为三个阶段：到2011年完成一期工程，确保首批学生入住新校区，力争完成教职工生活园区建设；到2013年基本完成教育园区和科技园区主体建设；到2015年，基本完成双福新校区建设。
学校将主要通过置换大坪校区、大坪分部筹集建设资金，同时积极争取政府和
社会支持，坚持量力而行分步实施，兼顾建设与运行；学校将制定新校区交通运行办法，参照其他高校的通常做法，根据实际情况给予新校区建设和工作的教职工适当交通生活补贴；学校将建设相应的后勤设施，既对外承担接待任务，又为教职工工作留宿提供方便；学校将继续加大人才引进的工作力度，以新校区的良好环境吸引更多高层次人才；学校将敦促双福新区建设好已规划的中小学和医院卫生等配套设施，同时力争学校教职工及其亲属享受江津现有的优质教育卫生资源服务，切实解决教职工生活的后顾之忧；学校将敦促
双福新区与九龙坡巴福镇和
九龙工业园，完善规划，强化管理，严控校区周边污染，为新校区创造一个美好环境；学校将继续深化改革，重心下移，权力下放，激发活力，开源节流，推进产学研结合，通过全校上下共同努力不断改善和提高教职工工作生活水平，促进学校又好又快、更好更快发展。
重庆交通大学科学城校区发展主要完成学校本科一、二年级的教学、教育任务，远期发展成为高水平、特色鲜明的以本科教育为主的现代化校区。提供多层次、多方位的学生课外活动条件，校舍功能、校园基础设施、服务设施基本配套，营造布局合理，设施齐全，环境优美的开放性、信息化、生态型的大学校园。
在我国大量新校园建设完成之后，重庆交通大学科学城校区等到了一个冷静的时机，来思考回顾，将最新校园规划研究成果，结合起地域特色和大学性格，以生态“参天地”，以理水“纳百川”，期待有机会，异起突出的生态文化特质，在校园文化史上，写下浓墨重彩的一笔。
面向未来，学校将秉承“明德行远、交通天下”校训，弘扬“甘当路石、进无止境”办学传统，立足西部，面向全国，争创一流，努力建设国际上有一定影响、国内知名，以工为主、多学科协调发展，特色鲜明、优势突出的高水平大学，为交通运输行业和地方经济社会发展做出积极贡献。