重庆地质矿产研究院成立于1953年，前身为四川煤田地质研究所，隶属于中国煤田地质总局，是中央在渝科研事业单位。1997年重庆直辖，更名为重庆煤田地质研究所。2007年5月经重庆市编委批准，更名为重庆地质矿产研究院，划归重庆市管理。2018 年 10 月，重庆市机构改革后，由重庆市规划和自然资源局主管。

至2022年，重庆地质矿产研究院（重庆华地资环科技有限公司，系重庆地质矿产研究院独资企业）有在职职工700余人，高级以上职称240余人，研究生学历290余人，国家级创新团队1支、省部级创新团队4支，累计培养国务院特殊津贴获得者、省部级科技创新人才、青年科技人才等高层次科技人才20余人。拥有国家级工程研究中心1个、省部级科研平台9个、国家重点实验室重庆研究中心3个，国家级博士后科研工作站1个、省级科学普及基地1个、省级“众创空间”1个。

2019年经重庆市政府批准，重庆华地资环科技有限公司成为重庆地质矿产研究院科技成果转化及推广应用平台，该企业自2018年至今连续被认定为“国家高新技术企业”。重庆华地资环科技有限公司先后与中国石油西南油气田分公司、国投矿业投资有限公司、中化石油勘探开发有限公司等3家中央企业出资成立了国投重庆页岩气开发利用有限公司、重庆页岩气勘探开发有限责任公司，引进全球最大的油气技术服务公司——斯伦贝谢公司合资成立中渝页岩气技术服务（重庆）有限公司，共同推进重庆市页岩气资源勘探开发，保障能源安全。

重庆地质矿产研究院（重庆华地资环科技有限公司）拥有自然资源部、住房和城乡建设部等国家部委，重庆市规划和自然资源局等政府部门颁发的地质灾害治理、环境污染治理、测绘、土地规划、水文地质勘察、岩土工程勘察、检验检测、煤炭工程设计、农业综合开发等以甲级、乙级为主的资质证书20余项。

自2005年以来，重庆地质矿产研究院累计承担320余项科研项目（其中省部级及以上科研项目130余项，含国家863计划、973计划、重点研发计划等国家级项目28项），获专利权和软件著作权210余项，发明专利、实用新型专利150余项，制（修）定国家标准8项、行业/地方标准30余项，发表科技论文1036篇（SCI/EI收录180余篇），出版专著29部。

先后荣获了全国国土资源管理系统先进集体、重庆市科技系统先进集体、重庆市文明单位、共青团全国“青年文明号”、第六届全国杰出专业技术人才先进集体等20余个省部级及以上先进集体荣誉；荣获自然资源部科技进步奖、教育部科技进步奖、重庆市科技进步奖、中国环境保护产业协会技术进步奖、中国交通运输协会科学技术奖等国家一级协会（学会）、省部级及以上科技奖50余项；30余人次科技工作者荣获中国地质学会“金罗盘奖”、重庆市“五一”劳动奖章、重庆英才创新创业领军人才、重庆市经济创新十大人物、重庆市担当作为好干部、重庆市最美科技工作者提名奖等省部级及以上个人荣誉。

设有机关管理部门10个，包括党政办、规划办、总工办、科研办、财务科、资采办、纪检审计室、基建办、后勤服务工作组、发展研究中心；设有二级实体（分院）13个，包括一所、三所、五所、六所、九所、地质灾害研究所、地质矿产信息所、检测中心、页岩气分院、生态修复分院、测绘权益工作组、乡村振兴与土地资源研究工作组、广西分院。