重庆工商大学食品科学与工程学院是重庆工商大学下设的二级学院，成立于2024年7月8日。

食品科学与工程学院始于1978年开办的化学教育、生物教育专业，是重庆市高校设置的四个食品类二级学院之一。学院现有食品科学与工程、食品安全与检测、制药工程等3个本科专业，食品科学与工程学术硕士、生物与医药类专业硕士等2个硕士专业。其中，食品科学与工程本科专业是国家一流专业建设点，食品安全与检测本科专业在全国仅有5所高校开设，西南地区高校中仅此一家开设此专业。学院依托现有的食品科学与工程（重庆市“十四五”重点学科）和重庆市特色农产品加工储运工程中心、天然药物研究重庆市高校重点实验室等2个省级科研平台以及重庆市食品营养与健康（火锅）现代产业学院1个省级教学平台，聚焦民生健康，服务重庆“食品与农产品加工”5千亿级产业高质量发展。

学院聚力打造农产品新质加工与资源挖掘、食品加工与风味调控、食品安全与质量控制、食品营养与健康科学等4个特色方向，做实做强“校企园”深度协同的新型产学研平台实体，筑牢食品与农产品加工产业新质发展的人才培养基石，以科技推动食品与农产品产业全链条增值，以食品安全与质量控制助力民生健康，全力服务国家战略和重庆经济社会高质量发展。