现为教育科学学院教育学系中国教育史教授、博士生导师，享受国务院特殊津贴。1991年获“全国优秀教师”称号。1994—1998年历任
华东师范大学教育科学与技术学院院长、学前教育与
特殊教育学院院长、华东师范大学教育学科
博士后科研流动站站长等职。
金林祥教授先后受聘担任
英国开放大学客座研究员（1999年）、日本名古屋大学客座教授（2000年）、美国纽约市立大学客座教授（2002年）等。
独立撰写及主编的主要学术著作有：《教育家黄宗羲新论》（获全国第三届优秀教育图书一等奖）、《蔡元培教育思想研究》、《中国教育思想通史》（第四卷）（获第二届国家图书奖提名奖、北京市第四届哲学社会科学优秀成果一等奖）、《中国教育思想史》（第三卷）（获上海市哲学社会科学优秀成果二等奖）、《中国近代学制比较研究》（获第三届国家图书奖提名奖）、《中国教育制度通史》（第六卷）（获第五届国家图书奖）、《
20世纪中国教育学科的发展与反思》、《
上海近代教育史》（获上海市第七届哲学社会科学优秀成果三等奖）、《思想自由 兼容并包——北京大学校长蔡元培》（获2003—2004年度山东省优秀图书奖）、《20世纪陶行知研究》等。合作编撰的著作有：《中国教育史》（获国家教委第三届高校优秀教材一等奖）、《中国书院史》（获第九届中国图书奖）、《
中国教育大系》（获第二届国家图书奖提名奖）等10余种。
另在《近代史研究》、《
高校理论战线》、《教育研究》、《华东师范大学学报》（教育科学版）等学术刊物发表各类文章100余篇。其中《加强教育与科技的联系，落实科教兴国战略》一文，入选中央宣传部等单位召开的“纪念党的十一届三中全会二十周年理论研讨会”，获上海市第三届邓小平理论研究和宣传优秀成果二等奖。