《长春中医药大学学报》创刊于1985年，是由吉林省教育厅主管，长春中医药大学主办的综合性学术期刊。

1985年，《长春中医学院学报》创刊，当时仅为内部刊物，试发行，每年出版4期。

1992年3月，经吉林省新闻出版局批准，获统一刊号，批准公开发行，为中文季刊。

1996年，该刊获得国际刊号。

2007年，由季刊改为双月刊；8月，随着长春中医学院更名为长春中医药大学，由《长春中医学院学报》更名为《长春中医药大学学报》。

2014年12月，该刊入选中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《长春中医药大学学报》辟有疫病专题、学术探讨、文献研究、量效研究、经验传承、实验研究、临床研究、护理研究、高教研究、综述等栏目。

《长春中医药大学学报》报道中医学、中西医结合、临床医学、中药学、药学、护理学等领域的新研究成果。

《长春中医药大学学报》以医药卫生科技人员为主要读者对象。

据2021年第5期《长春中医药大学学报》期刊封底页显示，《长春中医药大学学报》有责任编辑3人。

据2023年12月15日中国知网显示，《长春中医药大学学报》共出版文献量为12126篇。

据2023年12月15日万方数据知识服务平台显示，《长春中医药大学学报》共出版文献量为9805篇、基金论文量为4347篇。

《长春中医药大学学报》是中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）、中国学术期刊网络出版总库全文收录期刊、RCCSE中国学术核心期刊，被JST日本科学技术振兴机构数据库（日）（2018）等收录。

据2023年12月15日中国知网显示，《长春中医药大学学报》总被下载次数为2348235次、总被引次数为87572次；（2023版）复合影响因子为1.54、（2023版）综合影响因子为1.091。

据2023年12月15日万方数据知识服务平台显示，《长春中医药大学学报》被引量为74579次、下载量为560388次；据2021年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊影响因子为2.42，在全部统计源期刊（6250种）中排第580名。

《长春中医药大学学报》曾评为吉林省一级期刊。

2009年，该刊获全国高校科技期刊优秀编辑质量奖。

2015年，该刊被教育部科技发展中心评为中国科技论文在线优秀期刊二等奖。

2016年，该刊被中国高校科技期刊研究会评为中国高校优秀科技期刊。

2017年，该刊获首届吉林省高校科技期刊优秀奖。

2018年，该刊获评“中国最美期刊”。

《长春中医药大学学报》以“学术至上，质量第一，追踪前沿，突出特色”为办刊宗旨。

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