土地革命战争时期，中国共产党统一领导闽西地区武装斗争的军事机构。1932年2月，根据中革军委命令，闽西苏维埃政府军事部改称闽西军区，罗炳辉任总指挥，谭震林任政治委员兼政治部主任，尤瑞轩任参谋长。下辖红军第十二军、独立第七师和随营学校（后改称彭杨红军学校）。4月，闽西红军独立第七师撤销。5月，闽西军区在上杭、永定、武平、新泉地区成立（上）杭永（定）武（平）（新）泉指挥部；在长汀、连城、宁化、清流地区成立汀连宁清指挥部，分别指挥当地武装。10月，闽西军区重建红军独立第七、第九、第十师。12月，新建杭永岩红军游击纵队。1933年1月，闽西军区改编为福建军区。