陕西省水产研究所始建于1960年，为公益性全额拨款事业单位，隶属于陕西省水利厅。先后承担农业部、科技部、中国水产科学研究院、省科技厅、省水利厅等上级部门下达的科研项目200余项。

单位正式编制105人，在职96人。专业技术人员60人，研究员5人，其中高、中级专业技术职称38人，初级及以下技术职务17人,省突出贡献专家1人，省新世纪“三五”人才1人，享受政府特殊津贴1人，硕士研究生以上学历12人。

单位固定资产5000万元。有渔业资源与环境保护、水产品质量安全检测与风险评估、水产养殖与病害防治、分子生物学4个专业实验室1184㎡，各种仪器设备160余台（套）。有水产生物遗传育种、渔业生态环境与资源保护、水产品质量安全、水产养殖与病害防治等5个专业研究室。有陕西陇县秦岭细鳞鲑增殖放流站、陕西省团头鲂良种场、陕西合阳水产良种场3个中试基地，总占地面积450亩，总投资约2350万元。

截至2015年， 先后承担农业部、科技部、中国水产科学研究院、省科技厅、省水利厅等上级部门下达的科研项目200余项，荣获农业部丰收计划、陕西省科技进步、科技推广、陕西省水利科技进步奖50余项，发明专利2项，出版专著1部，在核心刊物上发表学术论文近400篇。获得国家级科技成果重点推广技术依托单位证书、对外技术贸易证书和享受免税政策认证书。