青岛黄海制药足球俱乐部由
青岛黄海制药有限责任公司出资组建。球队前身青岛金星足球俱乐部成立于2005年4月16日，2008年7月2日在青岛民政局注册成立
青岛衡业足球俱乐部。2012年1月13日，青岛衡业足球俱乐部黄海制药队宣布正式解散，球员大都被
胶州风发足球俱乐部安基电力队接收。2014年1月27日，黄海制药与安基电力达成协议，前者接手了后者队的队员及新赛季各项比赛的参赛资格（包括青超和
中国足协杯资格赛的资格）。2014年3月27日正式在工商部门注册成立“青岛黄海制药足球俱乐部有限公司”。2015年5月18日股权变更为青岛黄海源市政工程有限公司。
重返足球圈的青岛黄海制药足球俱乐部队以青岛风发足球俱乐部黄海制药队的名义顶替胶州风发足球俱乐部安基电力队参加了中国足协杯资格赛，并获得正赛资格。
2014年中国足球协会业余联赛上，青岛黄海制药队获得季军，并准备报名2015年
中国足球协会乙级联赛。但是在2015年1月23日，黄海制药股份有限公司与中甲青岛海牛足球俱乐部草签了股权转让协议，拥有俱乐部51%的股份，青岛海牛足球俱乐部冠以“青岛黄海海牛足球队”的名称征战2015年
中国足球协会甲级联赛。为此，原青岛黄海制药足球俱乐部放弃了2015年中国足协杯和中国足球协会乙级联赛的资格。
在2015年
青岛市足协杯上，原青岛黄海制药足球俱乐部队以恒星崇鼎队名义参赛，而以隋勇、王强、徐群、孙新铭等老队员组成的队伍则仍以黄海制药的名义出战。
青岛黄海制药足球队曾以青岛金星足球俱乐部黄海制药队（2005-2008年）和青岛衡业足球俱乐部黄海制药队（2009-2011年）名称参加
青岛城市联赛，并在2008-2011年间获得城市联赛和市超级杯的四连冠、市足协杯赛三连冠。
青岛衡业足球俱乐部黄海制药队在2011年青岛城阳举办的首届
亚足联中国展望城市联赛冠军杯中夺得亚军，从而夺得了2012年中国足协杯的参赛资格。但是在2011赛季后俱乐部却宣布解散，足协杯参赛资格也自动放弃。