青海省动物生态基因组学重点实验室，是我国乃至世界第一个专门针对青藏高原动物的研究和资源开发利用的专业平台，实验室的建立将为国际、国内科学家开展高原动物学研究提供良好的平台支持，也是我国高原生物科学研究走向国际的纽带。实验室将围绕青藏高原动物资源开发和利用、青藏高原野生动物管理、高原病机理研究和优秀遗传资源发掘和利用4个学科方向，开展有针对性的生态基因组学系统研究，为青藏高原动物资源开发和利用提供技术支撑与科学证据支持，将大大促进解决高原动物开发利用过程中的技术瓶颈，为青藏高原特色动物产业发展注入持续不断的活力和可持续发展的动力。

1．青藏高原动物资源开发和利用 重点开展青藏高原特有的畜禽品种改良工作和野生经济动物驯化繁育工作。利用和完善基因组学数据，运用生态基因组学方法筛选和鉴定青藏高原畜禽优良性状和不利性状，构建以物种为单位的遗传图谱，指导遗传育种。筛选有重大驯养潜力的野生动物物种，科学量化有代表性的生物性状，加速驯化繁育进度。

2．青藏高原野生动物管理 青藏高原众多野生动物中，一些为濒危珍稀物种，需要揭示产生濒危的生态学和遗传学机制，进而提出保护对策。相反，另一些则可能数量过多而成灾，需要对其种群进行限制。利用生态基因组学方法，可以使我们对这些动物的了解迅速进入到遗传学水平，从根本上制定科学合理的管理措施。

3．高原病机理研究 在基因组学水平比较高原和其他地区居民之间、患病和健康人群之间的基因变异和基因表达差异，筛选关键衡量指标。对高原野生动物如高原鼠兔、高原鼢鼠、藏鸡和平原动物如达乌尔鼠兔、甘肃鼢鼠、普通家鸡的上述指标进行比较分析，筛选与高原低氧适应的相关基因或调控网络，作为药物介入的备选靶点。同时，建立高原病易感和抗性动物模型，对现有高原病治疗药物进行动物试验，在基因组水平上综合判断药物的作用效果及其作用机制，科学筛选有效药物或配方。

4．优秀遗传资源发掘和利用 青藏高原具有低氧、寒冷、高紫外线等特征，高原动物在长期进化和适应过程中受到严重的自然选择，产生并固定了许多优秀的抗逆基因或调控机制。比较高/低海拔近缘物种或种群之间的遗传和表型差异，即有可能发掘和利用优秀的遗传资源。我们将对牦牛-黄牛、藏羚羊-藏羊-普通绵羊、藏鸡-海东鸡-普通家鸡、高原鼠兔-达乌尔鼠兔、高原鼢鼠-甘肃鼢鼠、湟鱼-普通鲤鱼，及不同海拔的上述动物种群之间等组合进行抗逆性状和相关位点的基因组学扫描，高效筛选抗逆相关基因，并联合遗传育种研究机构，共同探索抗逆基因的应用策略。

青藏高原是国际生物多样性热点地区，动物种类丰富、类型独特，具有重大科研和开发利用价值。长期以来，由于缺乏高效的研究开发手段，高原动物生物多样性保护和利用受到严重阻碍。“青海省动物生态基因组学重点实验室”建设，利用生态基因组学的前沿理论和实践方法，从根本上破解这一难题。 生态基因组学（Ecological genomics）是国际上近年来高速发展的一个整合生态学、分子遗传学和进化基因组学的新兴交叉学科，该学科将基因组学的研究手段和方法引入生态学领域，通过比较种内水平的遗传学差异，对在不同生态因子作用下的生物种群或个体之间的表型差异进行关联分析，从而加快筛选生物在生态学响应及相互作用中具有重要意义的关键基因和遗传途径，最终从基因水平探索有机体响应环境因子的遗传学机制。与传统的生态遗传学相比，生态基因组学以整个基因组为筛选对象，大大提高工作效率和分辨率，同时减少对有效基因或性状的潜在遗漏。而与传统的基因组学相比，生态基因组学以种内个体或种群为考察对象，其研究成果可直接应用到经济动物的开发利用工作中。