洪武元年(1368)置颍川卫于颍州（今安徽阜阳）。颍川卫治所与颍州州治同城，康熙《颍州志》：“卫与州同城，署在州署之后。”正统二年，颍川卫改隶
河南都指挥使司。清顺治十五年并卫入州，撤销颍川卫。
明朝建国初期，於各军事重地设立卫所，属于省都指挥使司管辖。颍川卫所设在颍州，属河南都司，卫籍诸生参加河南乡试。卫所制本是军事制度，由于实行时间较长，卫所名相沿成为地名，如天津卫等。而颍州作为行政区划在明代属于凤阳府，明正德《颍州志》说颍州辖“颍上、太和、亳三县，又以地交南北，故置颍川卫於州城，而以兵籍属之河南焉，所谓犬牙相制是也”。