颤藻目（Oscillatoriales），为一类原核生物，归于蓝菌门（Cyanophyta）蓝菌纲（Cyanobacteria）。
博氏藻科
(Borziaceae)
注：科名下方括号内为其英文名。“属”名以中文名后加英文名列出，无中文翻译时英文独占一行。截至目前科属收录不全。下同
博氏藻属 Borzia
Komvophoron
Proterendothrix
Sinaiella
Yonedaella
Gomontiellaceae
Gomontielloideae
发毛针藻属 Crinalium
Cyanarcus
Gomontiella
Starria
Hormoscilloideae
Hormoscilla
Katagnymene
微鞘藻科
(Microcoleaceae)
Ammatoidea
须藻属 Homoeothrix
Pseudoscytonema
颤藻科
(Oscillatoriaceae)
Blennothrix
鞘丝藻属 Lyngbya
颤藻属 Oscillatoria
织线藻属 Plectonema
席藻科
(Phormidiaceae)
微鞘藻亚科
(Microcoleoideae)
水鞘藻属Hydrocoleum
鞘丝藻属Lyngbyopsis
微鞘藻属Microcoleus
链鞘丝藻属Sirocoleum
束脉藻属 Symplocastrum
席藻亚科
(Phormidioideae)
节螺藻属 Arthrospira
极大节螺藻 A. maxima
钝顶节螺藻 A. platensis
胶鞘藻属 Phormidium
浮游蓝丝藻属 Planktothrix
紫管藻属 Porphyrosiphon
Pseudophormidium
束藻属 Symploca
束毛藻属 Trichodesmium
Tychonema
伪鱼腥藻科
(Pseudanabaenaceae)
Heteroleibleinoideae
Heteroleibleinia
Sokolovia
微丝藻属 Tapinothrix
Pseudanabaenoideae
Arthronema
Geitlerinema
Glaucospira
Jaaginema
Leibleinia
瘦鞘丝藻属 Leptolyngbya
湖生蓝丝藻属 Limnothrix
Planktolyngbya
伪项圈藻属 Pseudanabaena
罗氏藻属 Romeria
螺旋藻属 Spirulina
裂须藻科
(Schizotrichaceae)
裂须藻属 Schizothrix
螺旋藻属 Spirulina
节螺藻属 Arthrospira