首都医科大学附属北京中医医院内蒙古医院是国家区域医疗中心建设项目。

北京中医医院内蒙古医院新院区位于巴彦淖尔市，总占地面积142亩，建设总面积91500平方米，编制床位800张，总投资6.5亿元，接诊能力是老院区的5倍。医院开设中医专病门诊68个，开展中医诊疗技术项目77项。配备血管内超声（IVUS）/光学相干断层成像（OCT）一体机等40余种先进医疗设备与高层次专业人才队伍100余人。

2024年12月28日，内蒙古自治区首个中医国家区域医疗中心——北京中医医院内蒙古医院新院区在巴彦淖尔正式建成开诊。