首都医科大学附属北京友谊医院内蒙古医院是由内蒙古自治区人民政府举办，以首都医科大学附属北京友谊医院为输出医院，内蒙古自治区人民医院为依托医院，在内蒙古自治区呼和浩特市合作共建国家区域医疗中心。

首都医科大学附属北京友谊医院内蒙古医院以首都医科大学附属北京友谊医院为输出医院，内蒙古自治区人民医院为依托医院，旨在全面提升内蒙古地区疑难危重症救治能力和优势特色专科医疗综合服务能力。通过国家级高水平优质医疗资源的“强强联合”，力争实现大病不出区，让群众就近享有公平、优质、方便的医疗服务。

首都医科大学附属北京友谊医院内蒙古医院项目筹划在呼和浩特城区东部，规划用地面积约为20.0327公顷，总建筑面积187543平方米，设置床位数为1000张。

以消化、普外、泌尿3个专科为基础，以病理、影像、检验为支撑，逐步扩至其他专科技术合作与管理合作。

2024年7月29日，内蒙古自治区卫生健康委发布首都医科大学附属北京友谊医院内蒙古医院设置审批前公示。