《首都师范大学学报（自然科学版）》创刊于1976年，是北京市教育委员会主管、首都师范大学主办的自然科学综合性学术刊物。

1976年，《北京师院学报（自然科学版）》创刊。1980年，《北京师院学报（自然科学版）》被定为半年刊。

1986年，《北京师院学报（自然科学版）》被改为季刊并经国家新闻出版署批准国内外公开发行。

1992年，刊名随校名同步变更为《首都师范大学学报（自然科学版）》。

2006年，《首都师范大学学报（自然科学版）》经北京市新闻出版局批准改为双月刊。

《首都师范大学学报（自然科学版）》主要刊登数学、物理学、化学、生物科学、地球科学、环境科学、大气科学、交叉科学、科学史和教育学等相关研究的论文，以及学术述评与科研动态。

《首都师范大学学报（自然科学版）》主要包括基础理论、应用研究与科技开发的论文、科学实验的研究报告、学科教育学研究及学术述评、科研动态等栏目。

《首都师范大学学报（自然科学版）》读者对象为国内外高等院校的教师、科研工作者及研究生等。

据2020年8月2号官网显示，《首都师范大学学报（自然科学版）》编辑部有主编1人、编辑4人。

据2020年8月2日中国知网显示，《首都师范大学学报（自然科学版）》出版文献量为3601篇。

据2020年8月2日万方数据知识服务平台显示，《首都师范大学学报（自然科学版）总文献量为2210篇，总基金论文量为870篇。

《首都师范大学学报（自然科学版）》为中国科技核心期刊。中国知网期刊全文数据库（网络版）全文收录期刊，中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊，中国学术期刊综合评价数据统计源期刊，“万方数据—数字化期刊群”全文收录期刊，德国《数学文摘》（ZM）收录期刊，JST日本科学技术振兴机构数据库（2018）收录期刊等。

据2020年8月2日中国知网显示，《首都师范大学学报（自然科学版）》总下载次数为799017次，总被引次数为21705次。

据2020年8月2日万方数据知识服务平台显示，《首都师范大学学报（自然科学版）》， 总被引量为18703次，总下载量为112087次；据2017年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，该刊自然科学师范大学学报刊均影响因子为0.49，在全部统计源期刊（6719钟）中排第3323名。

据2020年8月2日维普网显示，《首都师范大学学报（自然科学版）》总被引量为610次，影响因子为0.465。

《首都师范大学学报（自然科学版）》反映首都师范大学的最新科研成果，促进学术交流，为中国“四化”建设服务。

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