从1999年在体校开始踢球,马晓旭就梦想代表中国站到国际赛场上。2006年随中国队参加
亚洲杯夺冠,凭借出色的表现,马晓旭当选了那年的
亚洲足球小姐。不过,此后三次受伤,她的
职业生涯起起伏伏。
2003年,15岁的马晓旭参加在上海举行的第二届中国青少年女足训练营,在训练营中,技术出色,攻击能力强的她给足协女子部主任
张建强留下了深刻的印象,结果在训练营结束后,马晓旭被直接调入中国中学生女足队,并在当年11月举行的首届世界中学生女足锦标赛上帮助球队获得冠军,这也是
中国女足各级别队伍中的第一个世界冠军。
2007年12月19日,在于
新西兰的热身比赛中,马晓旭在无人看防的情况下因突然变向伤了右膝
十字韧带,进而休养了半年。
2016年7月18日,
2016年里约热内卢奥运会中国
奥运代表团成立,马晓旭名列出征足球队女运动员名单。2016年11月,中国足协全国女足颁奖典礼于11月14日晚在广州举行,马晓旭包揽女超最佳射手、最佳运动员两项大奖。
2022年11月1日下午,本赛季女超联赛第13轮在云南
昆明海埂足球训练基地开踢,北京女足教练兼队员马晓旭替补登场,完成赛季“首秀”。