马祖历史文物馆座落在清水村胜利水库旁，在馆前罗列有四座雾炮，虽然年代久远却保存良好。

该炮座是由东莒岛移来至此，原是配合东莒灯塔，逢浓雾或视线不清时，辅助指引的功用，以引导海上渔船。还有闽浙总督告示石牌，却因长年受风吹雨打而字迹多模糊难辨。

馆内分为民俗厅、景文厅、振武厅、怀怀厅四大展示区，民俗厅及景文厅陈列历代马祖得文化资产，如服饰、器皿、古币、古花轿等；振武厅以图文资料展示马祖历史沿革；怀德厅陈列各级长官莅马巡视的纪录。从这些马祖昔日的各项生活器物、老照片中，可更进一步了解马祖人的生活方式！